分子内氢键是一种在分子内部形成的氢键，它与分子间的氢键不同，但同样的是分子间的相互作用。
分子内氢键是指分子中的 H 原子与分子中的较为负电的原子（如 N、O、F）形成的氢键。分子内氢键的存在是由于分子中含有活跃的 H 原子和一些能形成氢键的原子。这些原子分别带有正负电性，形成了相互排斥的电荷场。在特定条件下，这些原子的电性大小和位置相互影响，会引发新的分子内相互作用。
分子内氢键可以在有机化合物中被广泛地观测到。例如在蛋白质分子内，分子内氢键扮演着非常重要的角色。它参与了蛋白质的稳定化和构象调控。除此之外，分子内氢键还存在于生物体内的其他有机分子中。此外，分子内氢键还是很多药物的性质与作用的重要因素之一。
分子内氢键是一种很奇妙、神秘的分子内相互作用。在从事化学与生物学领域的研究时，需要探究它的作用机制和物理特性。
